为充分掌握大清查准备阶段各地进展和预分解登统数据及实际储存库点货位填报情况，省大清查领导小组办公室派出工作组，对各市州大清查工作进行全面检查。于3月18日至25日完成了对兰州、白银、金昌、定西、甘南5市州的检查，第二次检查从4月3日开始。
3月27日，省大清查领导小组办公室领导听取了检查组第一次检查情况的汇报，并作出批示。省大清查领导小组副组长、省发展和改革委党组成员、省粮食和物资储备局党组书记、局长段昌盛批示：“这次大清查不同于以往常规性检查，对存在的问题要高度重视，能提前整改的坚决整改，不能整改的如实反映，一定要把情况提前掌握。”省大清查领导小组办公室副主任、省粮食和物资储备局党组成员、副局长王春林批示：“这次派工作组下去，重点围绕前期准备，数据登统和货位填报，三个方面进行检查，发现了一些问题，下一步要针对存在的问题，加大工作力度。”
结合检查情况，省大清查领导小组办公室对下一步的工作作出了安排：
一是要提高认识，高度重视，切实把大清查工作牢牢抓在手上，落实到行动上。各市州大清查领导小组办公室主任、粮食和物资储备局局长要明确任务并切实负起责任，抓好大清查各环节的工作，对难度大的工作要及时向分管市州长汇报进展情况，引起足够的重视，取得政府有力的支持。
二是要聚焦查清库存数量和质量底数这个关键，创新工作方法，切实把管理责任落实到位，指导企业严格按照大清查相关要求认真扎实准备，确保大清查工作压茬顺利推进。
三是要本着实事求是的原则和科学严谨的态度，直面大清查的重点、难点，认真对存储的各类粮食数量分性质、分品种逐一核实。特别要重视已经下达的地方储备粮储存规模计划数量，除已下达的轮换计划正在出入库外，其余的务必均纳入清查范围。以摸清粮食库存数量为首要任务，迎难而上，坚决把3月底库存粮食准确分解登统，不再出现任何形式的失误。
四是要对所存储的各类粮食质量指标、品质指标和食品安全主要指标近3个月的检测结果认真分析，没有近3个月检测报告的，要抓紧在大清查质量清查工作开展前进行一次自检，真正做到底数清楚、心中有数。
五是要对分解登统数据、货位填报等重点环节，采取领导包保、专人负责的方式，确保报账单位、实际存储库点、货位明细表等各项数据100%准确。
六是要紧抓自查阶段之前的时机，紧扣问题导向，实事求是找问题，较真碰硬揭短板。对已开展的整改工作，必须事事件件要及时整改到位，并以点促面，开展一次大检查、大整顿，切实消除粮食安全隐患。对检查中发现的问题，要紧盯不放，绝不允许搞变通、打折扣，立行立改，为顺利进入普查阶段奠定良好基础。
