9月中下旬，省局大清查领导小组办公室派出3个督查组对14个市州大清查期间发现的所有问题整改情况逐一进行了督查，对40多户政策性粮食承储企业整改情况实地进行了查验。
本次督查主要采取听取汇报、查阅问题清单和整改台账、现场查验和询问相关人员的方式，对自查、普查、各级督导、系统录入和国家局梳理5个环节检查发现的问题逐条对照督查，特别是对正在整改和未整改的问题，要求各级大清查办督促承储企业制定明确的整改措施，限期整改到位。重点对国家局梳理出的问题，要紧盯不放。同时，对大清查质量清查问题的整改情况进行了核实。
督查期间，认真传达了省大清查领导小组副组长兼办公室主任、省粮食和物资储备局局长段昌盛，省大清查领导小组办公室副主任、省粮食和物资储备局副局长王春林在听取《关于对大清查检查发现问题梳理完善工作情况的汇报》时的指示精神，要求各级大清办高度重视检查发现问题的整改落实，对此次国家局梳理出的大清查检查发现问题引起高度重视，一定要盯住不放，及早制定措施，抓紧完成整改。
此次督查，总体看各市州大清查领导小组办公室对大清查发现的各类问题还是比较重视，都不同程度采取有效措施督促承储企业进行整改，对国家局梳理出的问题整改到位了66%。从整改力度看，有的市还有一定差距，存在问题整改进展缓慢，整改效果参差不齐的现象。
通过检查，各地一致认为，下一步要继续加大对大清查发现问题的整改力度，特别是本次督查后仍没引起重视和进展缓慢的各级大清查领导小组办公室和政策性粮食承储企业，要对问题分类别、分层次、分难易程度，责成逐条拿出具体整改措施、时限，确保全面完成大清查问题整改。
