甘肃省天水传染病医院是原甘肃省卫生厅于2003年5月批准的集医疗、教学、科研于一体的传染病专科医院，是国家公共卫生体系建设及突发公共卫生事件医疗救治体系的重要组成部分，主要承担我市两区传染病患者及五县重症传染病患者和辐射陇东南的应急医疗救治任务，传染病疫情暴发流行时的应急医疗救治任务。医院于2004年10月立项，2005年3月动工建设，2006年8月试运营，属国债资金建设项目。设置床位120张,占地面积30.5亩，建筑面积13418平方米，为县级事业单位。2006年9月27日经天水市卫生局批准医院加挂“天水市第五人民医院”牌子，原甘肃省天水传染病医院的职能定位和隶属性质不变。2013年确定为秦州区、麦积区结核病、艾滋病病人定点收治医院。

　　医院现有职工137人，其中副高级职称2人，中级职称14人，初级职称46人。

　　医院现有主要设备有:彩色多普勒超声诊断仪2台、DR X光机1台、500MA X光机1台、便携式可移动X光机1台、全自动生化分析仪2台、全自动血细胞分析仪1台、尿液分析仪1台、电解质分析仪1台、GeneXpertⅣ结核菌快速耐药检测设备1套、艾滋病病毒载量检测仪器1套、基因扩增热循环仪1台、核酸提取仪1台、微阵列芯片扫描仪1台、芯片杂交仪1台、芯片洗干仪1台、流式细胞仪1台、心电图机2台、心电监护仪10台、空气消毒机10台、生物安全柜6台。

　　医院从建院伊始，以突出传染病专科特色为突破口，坚持“以病人为中心，以提高医疗服务质量为主题”的服务理念，遵循“大专科、小综合”的建院原则，努力把医院建成“以救助各类传染病及应对各种突发公共卫生事件为主，以服务周边群众开展普通病种的预防、治疗为辅”的新型传染病医院。